我校2010年开始筹备档案室，2011年进行档案室基本建设，2012年4月6日正式设立了综合档案室并设立了声像档案分室和财会档案分室，成立了以董事长刘家全任组长、书记赵杭、校长卢山冰及副校长李彦亭任副组长的档案工作领导小组，配备专职档案员3人，兼职档案员41人。综合档案室舍建筑面积436.6平方米，分室面积约55.8平方米;设综合档案库、实物档案库、声像档案库、财会档案库四个库房(声像档案库与财会档案库分别设于声像档案分室和财会档案分室);各种现代化设备基本达到国家综合档案室建设标准，配备了档案密集柜20组，“南大之星”档案管理软件、打印复印扫描一体机、计算机、IBM磁盘阵列、实物档案展柜、高速文档扫描仪等设施设备。目前我校保存了建校以来党群、行政、教学、科研、出版、设备、外事、财会、基建、声像、实物、学生等十二大门类的档案。
近年来，综合档案室加大档案信息化、数字化建设。在建立初期就安装了“南大之星”档案管理软件，全校范围内使用档案管理软件进行档案的编目、检索、利用、统计、电子档案管理、检索工具编制等一系列工作。数字化建设方面，2014年派专职档案员参加了中国档案学会组织的“档案数字化专题培训”， 2015年学校配备了高速文档扫描仪，2018年再添高速馈纸扫描仪及数字化专用电脑，进一步加快了我校档案数字化进程。目前，已完成自建校以来所有学生学籍(包括学生登记表、成绩单、录检表、学士学位申请表等)、文书类、基建图纸等各档案的数字化，高利用率档案数字化程度达90%，2013年以后的学生毕业证、学位证也全部做了数字化。
综合档案室开展了多种形式的档案咨询服务和利用工作。编制了多种检索工具，建立了提供利用登记制度，从申请、审批、登记都有记录。开展档案咨询(含电话、口头、短信、信件等方式)，为师生解答疑问。2012年以来综合档案室接待档案咨询近万人次，查找利用档案资料八千多人次。
在全校各级领导及教工的大力支持下，综合档案室通过几年的不断努力，初见成效：
2013年学校被陕西省教育厅评为档案工作先进单位;
2012年——2017年学校连续五年被陕西省教育厅评为教育志鉴编纂工作先进单位，综合档案室同志被评为教育志鉴编纂工作先进个人;
2016年度综合档案室被学校评为先进部门;
2017年综合档案室同志在 “远洋杯”全省教育系统纪念《档案法》颁布30周年演讲比赛中获优秀奖。
2017年，综合档案室通知荣获“2017卷《陕西教育年鉴》优秀撰稿人”荣誉称号。
2018年我校再次被陕西省教育厅评为“档案工作先进单位”。综合档案室同志被评为档案工作先进个人。
2020年，综合档案室同志被学校评为“先进教育工作者”。
2021年综合档案室同志在 “远洋杯”全省档案演讲比赛中获优秀奖。
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